RAS 抑制剂博客缩略图及主图

靶向癌症中“不可成药”的 RAS 蛋白

RAS 蛋白:难以捉摸的靶点?

大约五分之一的人类癌症至少含有一种形式的 RAS 突变(K-RAS、H-RAS 和 N-RAS),这使得 RAS 成为人类癌症中突变频率最高的基因家族。RAS 蛋白位于细胞质膜上,充当发送细胞生长信号的分子开关。然而,RAS 蛋白的突变可能导致其持续活跃并失控地发送生长信号,从而引发细胞异常增殖和癌症形成。

尽管 RAS 突变普遍存在,但针对这些 RAS 蛋白的疗法却明显匮乏。三十多年来,人们一直在研究用于癌症治疗的 RAS 抑制剂,但由于 RAS 蛋白的抑制潜力难以捉摸,它们一直被视为“不可成药”的靶点——直到最近。今年早些时候,FDA 批准了索托拉西布(Sotorasib,由安进公司开发,商品名为 Lumakras™)用于治疗肺癌,这是首个获批的 RAS 抑制剂疗法。

Precision oncology: Reshaping the future of cancer care. Major challenges and opportunities exist across the entire cancer research and treatment landscape. Part of how we'll get there is through data-driven insights based on a comprehensive view of the available research.

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索托拉西布的获批是 RAS 抑制领域迈出的重要一步,针对 RAS 抑制剂的研发工作也随之加强。在此,我们将探讨如何缩小针对 RAS 蛋白的差距——那些曾经被认为难以捉摸、不可成药的靶点,如今正成为极具前景的癌症治疗方向。

K-RAS:RAS 基因中最常见的突变

RAS 基因编码的蛋白质存在四种亚型:K-RAS4A、K-RAS4B、N-RAS 和 H-RAS。突变的 RAS 亚型、密码子和氨基酸取代因组织和癌症类型而异,但最常见的是 K-RAS 亚型突变,约占 RAS 突变癌症的 22%。80% 的 K-RAS 突变发生在第 12 位氨基酸,由甘氨酸突变为其他残基,包括半胱氨酸(G12C,14%)、天冬氨酸(G12D,36%)和缬氨酸(G12V,23%)(图 1)。1

diagram showing types of K-RAS mutations in colorectal, pancreatic, and lung cancer
图 1:结直肠癌、胰腺癌和肺癌中 K-RAS 突变(第 12 位密码子)的类型


将 RAS 蛋白发现为癌症治疗候选靶点

利用 X 射线晶体学可以识别 RAS 抑制剂。通过这种方法,可以检查 RAS 蛋白结构,以确定小分子在人类癌细胞内占据的潜在结合口袋。这种基于结构的设计方法,使得发现数百种可能结合在特定口袋中的化学物质成为可能。潜在的 RAS 抑制剂通常由一个支架结构组成,该结构通过多种官能团进行微调,以增强活性、选择性并降低毒性。由此产生的先导化合物可进行进一步分析、优化和测试,以期在人类癌症临床试验中进行评估。

为了更深入地了解当前的 RAS 抑制剂格局,我们查阅了 CAS Content Collection™ 中与 RAS 抑制剂相关的专利和出版物。分析显示,有 26,958 种化学物质在直接 RAS 抑制领域具有治疗或药理作用。该领域的化学物质和专利数量逐年增加,这凸显了针对 RAS 抑制剂发现的研究兴趣和投入正在不断加快(图 2)。

Graph showing trend of RAS inhibitor patents by year
图 2:A:每年与直接 RAS 抑制剂相关的专利数量 - 以及 - B:每年添加到 CAS Content Collection 中的与直接 RAS 抑制相关的化学物质数量。


近期 FDA 对安进公司索托拉西布的批准,带动了 RAS 抑制剂发现研究工作的显著增长。索托拉西布是一种通过 Switch-II 口袋作用的 KRAS G12C 共价抑制剂。它是首个获批用于人类癌症治疗的 KRAS 抑制剂,用于治疗 KRAS G12C 突变的非小细胞肺癌(NSCLC)(图 3)。2

目前有四种额外的 KRAS-G12C 抑制剂处于临床试验阶段,包括 MRTX849,其核心结构与索托拉西布相似(图 4)2。不同的官能团导致了与 Switch II 口袋关键元件不同的结合机制。MRTX849 于 2021 年 6 月获得了 FDA 针对 KRAS G12C 阳性非小细胞肺癌的突破性疗法认定。

structure of sotorasib, an RAS inhibitor
图 3:索托拉西布的化学结构


Chemical structure of MRTX-849, a RAS inhibitor
图 4:MRTX 849 的化学结构


探索不止:拓展直接 RAS 抑制剂的靶点广度

随着更多 RAS 结合分子的发现,RAS 同工型和 RAS 蛋白上更多可作为潜在小分子靶点的表面正被识别出来。

由于突变的 RAS 同工型、密码子和氨基酸置换因组织和癌症类型而异,因此需要采用不同于现有 G12C 抑制剂的方法,以扩大癌症治疗的范围。未来的机遇包括扩展抑制剂可靶向的氨基酸类型(如 G12D 和 G12V),这有望拓宽我们能够治疗的癌症类型。

RAS 抑制的大门现已开启。通过深入了解 RAS 癌蛋白结构及小分子靶点的结合口袋构型,我们可以开发并优化新型 RAS 抑制剂,从而在 RAS 突变型癌症中实现最佳疗效。

参考文献

1.    H. Chen 等人,直接靶向 KRAS 的小分子抑制剂作为抗癌疗法。 J. Med. Chem. 63 (2020) 11404–14424. doi: 10.1021/acs.jmedchem.0c01312.

2.    L. Goebel 等人,临床试验中的 KRASG12C 抑制剂:简短的历史回顾。 RSC. Med. Chem. 11 (2020) 760. doi: 10.1039/d0md00096e.

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