冠状病毒的视觉呈现,即与 COVID-19 相关的病原体。

奥密克戎 BA.5 变异株为何能逃避疫苗

随着全球新冠病例的上升,奥密克戎亚型变异株 BA.5 现已成为席卷美国的优势毒株。新冠 BA.5 变异株持续发生突变,增强了其传播能力并逃避免疫。近期的一项预印本研究表明,再感染存在显著的健康风险,且新变异株可能对治疗性单克隆抗体(mAbs)的敏感性降低。本博客探讨了增强传播、逃避保护性抗体并导致更多再感染的关键突变。

突变提高了感染率

刺突蛋白是病毒进入人体的关键,也是许多新冠疫苗的靶点和中和对象。然而,奥密克戎变异株(BA.2.12.1、BA.4 和 BA.5)刺突蛋白近期的突变表明,病毒发生了增强传播能力的关键变化。

graphic showing key mutations on the spike protein for BA.2.12.1, BA.4, and BA.5
图 1. 与 BA.2 相比,BA.2.12.1、BA.4 和 BA.5 刺突蛋白上的关键突变。

如图 1 所示,这三种新毒株具有共同的关键突变,改变了受体结合结构域(RBD)的部分区域。这是刺突蛋白与细胞结合并实现感染的部分,也是保护性抗体的关键靶点。

BA.4 和 BA.5 中发现的 F486V 突变削弱了刺突蛋白与病毒受体的结合能力。然而,R493Q 回复突变恢复了受体结合能力,从而提升了病毒的适应性。

突变增强了对治疗的耐药性

虽然一些突变使病毒传播更快,但另一些突变则使病毒对现有疗法的敏感性降低。L452 处的突变可能有助于病毒更紧密地与细胞结合,从而躲避试图阻断病毒的抗体。研究人员认为,这种 L452 突变是新冠病毒对今年早些时候奥密克戎大规模感染浪潮的响应。BA.4 和 BA.5 还包含一个 N 端结构域(NTD)突变(Del69-70),该突变在历史上也曾改变结合亲和力,并消除了一个抗体结合位点。F486V 和 R493Q 突变也可能导致免疫逃逸,降低单克隆抗体的疗效,并最终增加治疗耐药性。

Bebtelovimab(CAS 登记号:2578319-11-4)是目前唯一临床获批用于治疗 BA.2.12.1、BA.4 或 BA.5 感染且对这些较新亚型保持效力的单克隆抗体。Bebtelovimab 是一种人免疫球蛋白 G-1(变体)单克隆抗体。

通过 CAS SciFindern 进行物质检索显示,该治疗药物包含四条蛋白质序列,即两条由 449 个氨基酸组成的相同重链多肽,以及两条由 215 个氨基酸组成的相同轻链多肽。如图 2 和图 3 所示,可在 CAS SciFindern 中查看其序列和修饰信息。

Portion of the Bebtelovimab protein sequence display from CAS SciFinder
图 2. 来自 CAS SciFinder 的 Bebtelovimab 治疗性抗体重链蛋白质序列信息。
screenshot from CAS SciFinder showing modified regions of Bebtelovimab protein sequence
图 3. 来自 CAS SciFinder 的 Bebtelovimab 治疗性抗体序列修饰信息。

近期发表在《新英格兰医学杂志》上的一篇文章展示了 BA.2.12.1、BA.4 和 BA.5 亚型如何逃避由疫苗接种和既往感染诱导的中和抗体。研究表明,针对 BA.4 或 BA.5 亚型以及 BA.2.12.1 亚型(程度较轻)的中和抗体滴度低于针对早期 BA.1 和 BA.2 亚型的滴度。这些发现为在疫苗接种率高且既往感染率高的群体中,由 BA.2.12.1、BA.4 和 BA.5 亚型引起的当前疫情激增提供了背景解释。

超越刺突蛋白突变

虽然 BA.4 和 BA.5 在刺突蛋白突变方面完全相同,但它们在刺突蛋白之外的区域既有共同突变,也有不同突变。这些突变影响病毒复制、感染率和治疗耐药性。BA.4 和 BA.5 均有两个突变回复到了原始病毒状态,即 Orf6 D61 和 NSP4 L438。研究人员认为这些突变会影响复制。Orf6 D61 常驻蛋白 Orf6 通过下调蛋白质、酶和各种信号来增强病毒复制。NSP4 L438 常驻蛋白 NSP4 参与形成双膜囊泡,也可能增强病毒复制。

BA.4 具有两个突变:Orf7B 中的 L11F 和核衣壳 (N) 蛋白中的 P151S,其对检测 N 蛋白的抗原测试的影响尚不明确。Orf7B 和 N 蛋白的突变都可能导致免疫逃逸。N 蛋白突变还可能影响病毒的稳定性,从而提高其适应性。BA.5 在膜 (M) 蛋白中含有一个 D3N 突变,这是一种相对罕见的突变。M 蛋白在抑制免疫方面发挥作用,并包裹着病毒,增加了细胞入侵和传播的可能性。

疫苗已被证明可有效预防住院

目前的 COVID-19 疫苗对有症状感染的保护作用微乎其微。明尼苏达州卫生部的数据显示,在 BA.5 变异株肆虐的 6 月和 7 月,已完全接种疫苗的人群与未接种疫苗的人群感染几率几乎相当(图 4)。然而,观察住院率时,差异则非常显著,未接种疫苗人群的住院人数明显更高(图 5)。

目前的疫苗确实能很好地预防严重症状、住院和死亡。这些疫苗产生的免疫力有助于患者的免疫系统对抗病毒,从而降低了出现严重症状和住院的可能性。

Covid Vaccine Breakthrough Data of cases
图 4:明尼苏达州卫生部的疫苗突破性病例数据 https://www.health.state.mn.us/diseases/coronavirus/stats/vbt.html
Covid Vaccine Breakthrough Data of hospitalizations
图 5:明尼苏达州卫生部的疫苗突破性住院数据。来源:https://www.health.state.mn.us/diseases/coronavirus/stats/vbt.html

发表在《新英格兰医学杂志》上的一篇文章讨论了目前的 COVID 疫苗对 BA.1 和 BA.2 变异株的有效性。这种交叉免疫自疫情初期就已得到认可。有证据表明流感、麻疹、肺炎和脊髓灰质炎疫苗都能提供一定程度的抗 SARS-CoV-2 感染保护。据梅奥诊所称,在过去一年中接种过肺炎疫苗的人群,其 COVID-19 感染风险降低了 28%,而接种过脊髓灰质炎疫苗的人群,其 COVID-19 感染风险则降低了 43%。

后续步骤:我们该何去何从?

随着病毒在全球范围内持续变异和演化,COVID-19 疫情并未放缓。如上所述,目前的疫苗在预防重症、住院和死亡方面仍然非常有效。然而,由于对 COVID 的疲劳感,许多人尚未接种建议的加强针疫苗。如果个人符合条件但尚未接种加强针,应尽快接种。在封闭、拥挤的环境中重新加强佩戴高质量口罩的力度,也将有助于遏制有症状感染。

辉瑞和莫德纳均已开发出基于新型 BA.1 变异株的疫苗,预计将于 2022 年秋季在美国上市。然而,既往 BA.1 感染对较新变异株提供的保护有限,这引发了人们对这种第二代疫苗实用性的质疑。未来,更新的疫苗技术结合针对更广泛抗原的抗病毒疗法,将是阻断病毒传播的必要手段。

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