A previsão da função de proteínas avançou consideravelmente na última década, coincidindo com o surgimento de novos métodos computacionais de aprendizado de máquina e inteligência artificial. Neste artigo, conversamos com Iddo Friedberg, Ph.D., especialista em previsão da função de proteínas e coorganizador do experimento Critical Assessment of Function Annotation (CAFA), sobre o grau de precisão dos modelos que preveem a função de proteínas e como ele imagina o que se seguirá nesse campo.
CAS: Como surgiu seu interesse pela previsão da função de proteínas?
CAS: Como o campo da previsão automática da função de proteínas evoluiu desde que você começou?
CAS: Algumas abordagens para a previsão da função de proteínas estão funcionando melhor do que outras?
CAS: À medida que as previsões da função molecular melhoram, até que ponto conseguiremos prever processos biológicos e componentes celulares?
CAS: O que você apontaria como os principais gargalos na área?
CAS: Claramente, um dos principais gargalos não é computacional, mas que trabalho experimental de laboratório tem sido feito e publicado?
CAS: Você acha que os avanços recentes nos modelos de processamento de linguagem natural (PLN) podem ser usados para biocuradoria?
CAS: Na sua opinião, quais são as grandes oportunidades na previsão da função de proteínas no momento?
CAS: Se você tivesse uma varinha mágica para mudar alguma coisa no processo de descoberta de medicamentos, o que mudaria?
Iddo Friedberg, Ph.D., é professor associado da Faculdade de Medicina Veterinária da Iowa State University. Com doutorado em bioinformática, Iddo desenvolveu sua carreira em metagenômica computacional e previsão de função de proteínas. Sua pesquisa visa utilizar a grande quantidade de dados ômicos disponíveis para prever a função de proteínas e genes e ele trabalha para reunir cientistas com ideias semelhantes para discutir a previsão automática da função de proteínas. Como co-organizador do Critical Assessment of Function Annotation (CAFA), um experimento projetado para apresentar uma avaliação em larga escala de métodos computacionais dedicados à previsão da função da proteína, Iddo está na vanguarda do Futuro da previsão da função da proteína.