Você precisa de um biólogo computacional para análise de sequência?

Uma conversa com Jefferson Parker, Ph.D. fundador da NullSet Informatics Soluções

Transparent blue capsules each holding intricate structures resembling cells or circuits.

À medida que a biologia computacional continua avançando na descoberta de medicamentos, novos desafios e oportunidades surgem constantemente. A análise de sequência é um aspecto fundamental da bioinformática. Nesse artigo, falamos com Jefferson Parker, Ph.D., fundador da NullSet Informatics Solutions e especialista em análise de dados em ciências da vida, sobre as novas fronteiras da análise de sequência na descoberta de medicamentos.

CAS: Como biólogo computacional, que funções você já desempenhou na descoberta de medicamentos?

CAS: Por que a análise de sequência é importante na descoberta de medicamentos?

CAS: Onde você acha que estão os maiores desafios da análise de sequência?

CAS: Hoje você realmente precisa de um biólogo computacional para fazer análise de sequência?

CAS: A IA e o ML podem ser úteis na análise de sequência?

CAS: Quais são suas opiniões sobre o AlphaFold, que realiza previsões de estruturas de proteínas por meio de IA?

CAS: O que você acha que é a vanguarda de IA e ML na descoberta de medicamentos?

CAS: Você acha que vamos criar modelos de sistemas biológicos?

CAS: O que você acha que é necessário para impulsionar essas novas fronteiras? Novos algoritmos, novas estruturas ou algo mais?

CAS: Se você tivesse uma varinha mágica para mudar alguma coisa no processo de descoberta de medicamentos, o que mudaria?

Jefferson Parker, Ph.D., iniciou sua carreira de pesquisa no MIT, explorando o metabolismo de xenobióticos na bactéria do solo gram-positiva Rhodococcus aetherovorans. Entrou na computação quando se deparou com uma sobrecarga de dados tentando anotar o genoma para desenvolver microarrays de DNA e trabalha na interseção de biologia, computação e matemática desde então. Sua carreira o levou a pequenas empresas farmacêuticas, grandes farmacêuticas e organizações de consultoria, incluindo Novartis e Thomson Reuters. nessa jornada, Jefferson adquiriu seu certificado de pós-graduação em estatística aplicada pela Pennsylvania State University e um mestrado em ciência da computação pela Boston University. Jefferson também abriu um novo caminho com sua própria empresa de consultoria em bioinformática, a NullSet Informatics Solutions, entregando dados e analytics, modelagem de dados e Serviços de gerenciamento de projetos de tecnologia.