Las prácticas de indexación de CAS evolucionan con el tiempo en respuesta a los avances científicos. En la década de 1990, con el rápido progreso de la biotecnología y la "revolución genómica", CAS comenzó a registrar no solo las secuencias encontradas durante el análisis de literatura científica y patentes, sino también todas las secuencias añadidas a GenBank®, incluso aquellas no mencionadas en la literatura. CAS revisó su política de cobertura en 2005. A partir de ese momento, CAS (1) limitó el registro de secuencias de GenBank a aquellas reportadas en artículos de revistas o patentes y (2) dejó de añadir a CAS REGISTRYSM cualquier secuencia proveniente de patentes que contuvieran más de aproximadamente 4.000 secuencias. En 2007, CAS dejó de añadir a CAS REGISTRY las secuencias de GenBank presentes en artículos de revistas que hicieran referencia a más de 500 números de acceso de GenBank. Desde mayo de 2014, CAS ya no gestiona secuencias no reivindicadas en patentes. CAS continúa gestionando e incorporando a CAS REGISTRY las secuencias reivindicadas y ejemplificadas en patentes.
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